Os fatores sabidamente conhecidos na litogênese são: epidemiológicos, hiperexcreção, pH urinário, volume urinário, inibidores e promotores de cristalização. A partir de um, ou da somatória desses fatores ocorrerá o desenvolvimento de toda a cascata de eventos que se caracterizam pela urina supersaturada com sais insolúveis, formando cristais que se agregam em um núcleo, que se adere ao sistema coletor urinário implicando na precipitação de mais cristais levando ao crescimento do cálculo.

Dentre os fatores epidemiológicos é interessante salientar o papel da dieta, história familiar, sedentarismo, região onde mora, tipo de trabalho e raça. Dos fatores de hiperexcreção é fundamental o papel da hiperexcreção de cálcio, ácido úrico, oxalato e muito raramente cistina e xantina. Dos fatores inibidores de cristalização os mais conhecidos são: citrato, magnésio, pirofosfato, nefrocalcina, proteína de Tamm-Horsfall, glicosaminoglicans principalmente o heparan-sulfato. Vários promotores já foram identificados dentre eles se destacam: fosfolípides, membranas, restos celulares, células tubulares, uratos e algumas proteínas. O pH urinário é outro fator importante pois a solubilidade de algumas substancias alteram com mudanças no pH urinário. Outro fator é o volume urinário reduzido levando consequentemente à supersaturação. Dessa forma o conhecimento das causas de todos esses fatores e ainda mais a interrelação entre eles é fundamental para entender a formação de novos cálculos. De fato esse processo de doença faz lembrar o caos, que se caracteriza por processos ou modelos simples os quais inativamente ordenados podem induzir a comportamentos altamente irregulares. Assim minúsculas variações em alguns determinantes dentro de um sistema pode provocar efeitos monumentais, esse fenômeno é também conhecido como "The Butterfly Effect". Como em qualquer sistema caótico os princípios básicos da patogênese do cálculo renal são enganosamente fáceis de identificar e descrever. Esse processo ainda misterioso é o resultado de um fractal. Provavelmente os cálculos renais assim como vários outros achados da natureza são exemplos de fractais. 

O tratamento da nefrolitíase se divide em medidas gerais e medidas específicas. Nas medidas gerais são recomendados grande ingestão líquida com pelo menos 50% em água, exercícios físicos e orientação dietética. Nas medidas específicas será indicado o uso de certas drogas de acordo com o diagnóstico apresentado. Naqueles casos onde os cálculos não são eliminados espontaneamente a sua retirada será realizada através de cirurgia aberta ou percutânea e/ou litotripsia extracorpórea por ondas de choque.